2008年に公開された映画『リリィ、はちみつ色の秘密』は、スー・モンク・キッドの小説『リリィ、はちみつ色の夏』を映画化した作品で、ダコタファニングは、主演を務めました。

2004年に公開された映画『マイ・ボディガード』は、全米では初登場1位、5日間で2279万ドルの興行収入を上げるヒットを記録しました。ダコタファニングは、実業家の娘ピタを演じました。共演した俳優のデンゼル・ワシントンに「僕が会った役者の中で本当に優れているのはジーン・ハックマンとダコタ・ファニングだけだ」と言わしめた名演技に注目です。

2005年に公開された映画『夢駆ける馬ドリーマー』は、王道のアメリカンドリーム映画で、実話を元に作られた作品です。ダコタファニングは、主人公の調教師の娘役を演じました。

2001年に公開された映画『アイ・アム・サム』は、知的障害を持つ父親と、幼い娘との純粋な愛をビートルズの曲とともに描いたドラマ映画で、ダコタファニングが一躍有名になるきっかけとなった作品です。ダコタファニングは、主人公のショーン・ペンの娘役を演じました。『アイ・アム・サム』での演技が高く評価され、各種新人賞を総なめにし、注目を集めました。