その後、1865年4月10日に北軍が勝利し、南北戦争が終結を迎えます。その翌日リンカーン大統領は、黒人に参政権を認めたい演説を行い、それを聞いたブースが怒り、誘拐計画から暗殺計画へと変わっていきます。

少し遅れフォード劇場に着いたリンカーン夫妻は、ヘンリー・ラスボーン少佐とその婚約者のクララ・ハリスと共に『われらのアメリカのいとこ』を観劇していました。

その直後、ブースがリンカーンの頭めがけてデリンジャーピストルを発射したのです。大統領は前のめりに倒れ、これに気付いたラスボーンがブースに飛び掛かります。

しかしブースは、2階席から舞台に飛び降りて、劇場の裏口から待たせていた馬車に乗って逃走しました。

ウィリアム・スワード殺害を依頼されていたのはルイス・パウエル。この時スワードは馬車の事故で養生を余儀なくされていました。

しかし、スワードの息子のフレデリックがパウエルを止めたので、いったん帰る素振りをしますが、踵を返してフレデリックの頭をリボルバーで殴打します。

フレデリックが倒れると、すかさずスワードの寝ている部屋に押し入って、ナイフで何度もスワードを刺しているところを、看護兵のジョージ・ロビンソン軍曹とスワードの息子のオーガスタス・スワードが飛び掛かって食い止めます。

リンカーン大統領の暗殺を受け、アメリカ合衆国最大の捜査が始まった中、ブースとヘロルドは逃走後落ち合うことに成功します。その後南軍工作員の医師サミュエル・マッドによりブースの骨折治療を行い、下院議員のサミュエル・コックスの手引きで、南軍支持者の多いバージニア州に逃げるボートと羅針盤を渡されます。

4月24日に着くと、南軍の兵士と偽ってリチャード・ギャレットという人物の農園に泊めてもらうことに。しかし、その言葉を疑ったリチャードは、2人を倉庫に連れて行ってカギをかけたのでした。

その近くを捜査していたエヴァートン・コンガー大佐率いる捜索隊が2人の情報を聞き出し、リチャードの農園で聞き込みをしたところ、倉庫にいることを聞き出してヘロルドは投降しますが、ブースは逮捕に抵抗しました。

その傷は奇しくも、ブースが暗殺したリンカーン大統領の傷とそっくりだったそうです。傷を手当てしようとしますが拒否され、「母に私は国のために死んだと伝えてくれ」と言い残して苦痛の中死んでいきました。

その後共犯者として捕らえられた者も含めて8人の裁判が行われました。判決は、メアリー・サラット、ルイス・パウエル、デイヴィッド・ヘロルド、ジョージ・アツェロットが絞首刑、サミュエル・マッド、サミュエル・アーノルド、マイケル・オロフレンは終身刑、エドマン・スパングラーは懲役6年となりました。

尚、メアリー・サラットの絞首刑は、アメリカで最初の女性の絞首刑ということです。執行は1865年7月7日でした。また、終身刑の1人であるマイケル・オロフレンは2年後の1967年に黄熱病で死亡しました。

リンカーン大統領の死はアメリカの国民にも大きな影響を与えました。国中でリンカーンの死を悼み、ブースに賛同した者は激しい攻撃を受けます。

リンカーンの死から2日後は復活祭で、全国の教会が追悼説教を行っています。また、1865年4月19日に執り行われたリンカーン大統領の葬儀には、全国から数万人が集まりました。